L'histoire prend place en octobre 2011, dans une ville dont nous n'avons pas le nom. Deux ans avant le début du jeu, le héros, Ethan Mars, vivait une vie agréable avec ses deux enfants, Shaun et Jason, et sa femme, Grace, mais un malheureux accident survint qui provoqua la mort de Jason. Quelques années plus tard, Ethan et Grace ont divorcé et alors qu'Ethan avait la garde de Jason, celui-ci se fit kidnapper par le mystérieux Tueur aux Origamis. Ce dernier kidnappe des enfants et les enferme dans une bouche d'égout jusqu'à ce la pluie noie ces derniers. Lorsque ses victimes décèdent, il laisse un origami dans la main de celles-ci.
Lorsqu'il fait de Shaun sa victime, Ethan décide de remuer ciel et terre afin de retrouver et sauver son fils, en compagnie de l'agent du FBI Norman Jayden, du détective privé Scott Shelby et de la journaliste Madison Paige. Alors que les autres héros décident de mener l'enquête de leur côtés, le fameux Tueurs aux Origamis décide de faire un "jeu" avec Ethan en lui laissant des outils, et notamment un portable et une arme à feu, qui lui donneront des indices sur l'emplacement de son fils. La majorité des missions d'Ethan seront constituées de ces fameuses épreuves.
En fonction des choix que le joueur prendra, différents événements se produiront et plusieurs fins sont possibles (18 au total), ce qui fait que les parties peuvent totalement différer les unes des autres.
Le gameplay a assez mal vieilli ce qui fait que le jeu est un peu dur à reprendre en mains mais pour le reste il est toujours aussi excellent et je me demande juste quelle fin je vais débloqué cette fois.
